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「博彩送60」不做实验也能发表SCI,除了meta分析,还有它……

2020-01-11 18:59:23   【浏览】1952

摘要: 每当人们谈及“不做实验、不做调研、没有原始数据,也可以发表sci”,你最先想到的是不是meta分析?其实,近几年除了meta分析,还有一个非常火热的sci神器:基于生物信息学分析的数据挖掘。打个比方,仅知道meta分析的流程和常用方法,缺乏对选题的把握和讲故事的能力,是无法满足sci越来越高的发表要求的。

「博彩送60」不做实验也能发表SCI,除了meta分析,还有它……

博彩送60,每当人们谈及“不做实验、不做调研、没有原始数据,也可以发表sci”,你最先想到的是不是meta分析?其实,近几年除了meta分析,还有一个非常火热的sci神器:基于生物信息学分析的数据挖掘。

高通量(二代测序/基因芯片)数据的挖掘与分析是基于生物信息学的方法,通过不断完善更新的算法,找到与研究方向最相关的靶标基因(mrna,mirna,lncrna或蛋白)。随着高通量技术的发展,测序和芯片的成本逐渐降低,效率也越来越高,使用高通量数据进行科研的优点非常明显,也是大势所趋!

然而,现阶段大部分人员对高通量数据挖掘的认识还停留初级阶段,有的听说过这个技术,有的只了解一些标准化分析:过滤、质控比对、定量和差异等。可是,这些是不足以帮助我们发表sci的。打个比方,仅知道meta分析的流程和常用方法,缺乏对选题的把握和讲故事的能力,是无法满足sci越来越高的发表要求的。

如果接触过生物信息学的数据挖掘,你是否遇到过这样的问题?

你是否充分了解ncbi数据库的内涵和常用于数据挖掘的数据库?

你是否懂得如何制作、解读聚类热图?

上海班:2019/1/12-13 (11号报到)上海好望角饭店

学习班简介

高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mrna,mirna,lncrna或蛋白)。随着高通量手段的不断进步,测序和芯片的成本也逐渐降低,速度也越来越快,使用高通量手段(测序/芯片)进行科研的优点非常明显,也是大势所趋! 做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!

通过该主题的学习,可以学会:高通量公共数据的详细信息查找/下载;在线做差异表达分析在线blast分析基因id转换通路map图制作功能富集分析蛋白互作分析网络图的构建和美化。

讲师简介

宋伟博士成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、r等编程语言。培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《r语言培训》等

课程具体安排

课程安排:1、理论课程:第一天上午8.30-10:00第一节:基因数据库使用介绍测序标准报告的解读。ncbi gene数据库:最权威的基因综合数据库之一。ncbi geo数据库: 数据量最大的高通量公共数据库。geo2r工具:在线做差异分析的r工具biodbnet:在线基因id转换工具。uniprot: 最权威的蛋白综合数据库之一。

10.15-12:00第二节: david工具——功能富集分析功能富集的原理和意义基因id转换基因功能注释(go ,kegg pathway)基因功能富集(go ,kegg pathway)基因功能聚类(go ,kegg pathway)

2、实践操作课程(共1天半)第一天下午13:30-17:30第三节 聚类热图及pathway map图kegg 数据库:最权威的通路数据库(pathway map 分析)hemi软件:构建聚类热图的本地软件

第二天上午

8:30-10:00第四节. string工具——基因/蛋白相互作用分析(ppi)蛋白互作分析的原理和意义;单个蛋白的蛋白互作分析;多个蛋白的蛋白互作分析;string工具的使用步骤:输入、参数设置、输出等。

10:15-12:00第五节 cytoscape网络做图软件(上)网络图构建逐个修改节点的属性和修改边的属性网络展示方式layout更美观网络统计分析13:30-15:30第六节 cytoscape网络做图软件(下)批量修改节点的属性和修改边的属性cytoscape的常用插件:clusteronecytoscape的常用插件:bingo15:30-17:00 答疑环节

学习费用

学习费2800元每位(学习费包含电子版教材、午餐,住宿费自理,保证学员完全掌握。)

优惠政策:1. 提前支付转账的可提前拿到学习资料2. 三人组团报名,每人收费2700元3. 四人组团报名,每人收费2600元4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册! 5. 参加过医药加tcga/geo数据挖掘的学员只要再支付1000元

报名咨询与报名方式

报名咨询可联系 金老师 18917745941 王老师 13818765978

2019/1/19-20(18号报到)

上海浦东中兴和泰酒店

培训简介: 癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。tcga数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对tcga数据库的使用近几年也在逐渐增加!如图1所示。

图1 基于 pubmed数据库检索的包含“tcga”发表的sci 文章数量(2018年11月7日)

关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mrna,mirna,lncrna或蛋白)。 因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路,从海量信息中获得自己想要的关键基因!

培训预期:1. 通过整整两天的培训,掌握tcga,geo数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。

2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频,用于学员的复习。

4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书(医药加高价值标书库里面选择)5. 讲师团队赠送tcga数据库甲基化,基因表达谱整合分析报告与疾病mrna+lncrna分析报告

报名咨询

近期医药加学习班安排如下,如需要报名,请加学习班秘书微信yiyaojia01


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